Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC9O14530 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC9O14530 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms