Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms