Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
S4R3C0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S4R3C0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
S4R3C0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
S4R3C0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
S4R3C0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
S4R3C0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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