Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDY1Q9Y6F8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDY1Q9Y6F8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms