Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms