Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms