Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRP2BPQ9P2M1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms