Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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