Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6AQ9NYA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms