Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4ENIF1Q9NRA8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4ENIF1Q9NRA8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms