Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms