Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOBEC3GQ9HC16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms