Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD4Q9H223 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD4Q9H223 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms