Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms