Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRQ99707 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRQ99707 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRQ99707 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTRQ99707 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms