Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3CQ99613 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms