Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms