Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms