Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP53Q96M91 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms