Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms