Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF428Q96B54 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF428Q96B54 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms