Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms