Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms