Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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RNF169Q8NCN4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF169Q8NCN4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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