Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms