Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT2Q8IXI1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOT2Q8IXI1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms