Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8AQ8IWT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms