Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms