Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms