Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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