Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms