Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3F3CQ6NXT2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms