Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEPROQ6NW34 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms