Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms