Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms