Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC181Q5TID7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC181Q5TID7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms