Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIVEP3Q5T1R4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms