Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP55Q53EZ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms