Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN2Q52LD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms