Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms