Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms