Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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