Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3A2Q15428 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3A2Q15428 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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