Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF1Q14162 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms