Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBFBQ13951 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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