| RUNX2 | Q13950 | DYRK3-202 | ENST00000367108 | 2218 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.16 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LBX2-203 | ENST00000460508 | 1452 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.16 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM62-201 | ENST00000260403 | 2771 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GTF2IRD2B-208 | ENST00000619142 | 1932 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSBPL10-204 | ENST00000438237 | 2624 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CBY3-201 | ENST00000376974 | 785 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SERPINH1P1-201 | ENST00000419794 | 1249 nt | BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091874.3-201 | ENST00000512672 | 1195 nt | BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BET1L-207 | ENST00000529614 | 560 nt | TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C2orf69P4-201 | ENST00000565394 | 541 nt | BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | YIF1B-213 | ENST00000591755 | 1077 nt | TSL 2 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGIX-202 | ENST00000595224 | 1238 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OGFR-204 | ENST00000621591 | 1194 nt | TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTCD3-220 | ENST00000627371 | 210 nt | TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FBXO31-207 | ENST00000618298 | 1871 nt | TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTLL7-214 | ENST00000610996 | 2028 nt | TSL 5 BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ETV7-203 | ENST00000373737 | 1488 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 19.15 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MFSD10-206 | ENST00000508221 | 1639 nt | TSL 5 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COMT-202 | ENST00000361682 | 2437 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPPL2B-212 | ENST00000618220 | 2459 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC2A8-215 | ENST00000610552 | 1763 nt | TSL 3 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.66 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RLBP1-201 | ENST00000268125 | 1810 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHRNA3-202 | ENST00000348639 | 2030 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069152.1-201 | ENST00000438030 | 544 nt | BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD65-202 | ENST00000442470 | 876 nt | TSL 2 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGI2-AS3-209 | ENST00000448195 | 774 nt | TSL 3 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01962-201 | ENST00000513771 | 411 nt | TSL 2 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TP53I11-215 | ENST00000531928 | 1078 nt | TSL 3 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EMC9-206 | ENST00000560403 | 872 nt | TSL 2 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATRAID-208 | ENST00000611786 | 1256 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP1B1-207 | ENST00000614273 | 2174 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01006-201 | ENST00000333319 | 2292 nt | BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DTD1-201 | ENST00000377452 | 1387 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APPL2-201 | ENST00000258530 | 3239 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005233.1-201 | ENST00000562341 | 2424 nt | TSL 2 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FUZ-212 | ENST00000528094 | 1479 nt | TSL 2 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPATA5L1-201 | ENST00000305560 | 2570 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SH3BGRL3-201 | ENST00000270792 | 1661 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRRT4-207 | ENST00000535159 | 2897 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 19.14 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNF32-207 | ENST00000405335 | 1938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EPHA6-202 | ENST00000470610 | 2058 nt | TSL 2 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RIPPLY3-201 | ENST00000329553 | 2235 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | QKI-201 | ENST00000275262 | 6964 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZDHHC8P1-201 | ENST00000255890 | 2382 nt | TSL 2 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MEDAG-201 | ENST00000380482 | 2374 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLK3-202 | ENST00000395066 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUDT22-201 | ENST00000279206 | 1094 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM218-201 | ENST00000279968 | 1034 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MDK-204 | ENST00000395569 | 686 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GNAS-AS1-201 | ENST00000424094 | 1156 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073210.2-201 | ENST00000430369 | 194 nt | BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUDT22-204 | ENST00000441250 | 986 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RHEB-204 | ENST00000472642 | 900 nt | TSL 3 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099522.1-201 | ENST00000505955 | 881 nt | TSL 3 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYC-209 | ENST00000641252 | 345 nt | BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC133041.1-202 | ENST00000642053 | 222 nt | BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FN3K-201 | ENST00000300784 | 1434 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MORN1-202 | ENST00000378529 | 1500 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TACC3-213 | ENST00000617535 | 1693 nt | TSL 5 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST3GAL4-204 | ENST00000444328 | 1812 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPON2-201 | ENST00000290902 | 1869 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABARAPL3-202 | ENST00000624044 | 1851 nt | BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGDIA-201 | ENST00000269321 | 1906 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNUPN-205 | ENST00000564644 | 1931 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C17orf67-201 | ENST00000397861 | 2013 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SDHAF3-202 | ENST00000432641 | 2060 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ESR2-204 | ENST00000353772 | 2454 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.13 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GUCY1A3-210 | ENST00000513574 | 2656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FBXO25-203 | ENST00000352684 | 2360 nt | TSL 5 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DISC1-213 | ENST00000537876 | 2349 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DET1-207 | ENST00000564406 | 2315 nt | TSL 2 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACHE-207 | ENST00000428317 | 2159 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FOXI1-202 | ENST00000449804 | 2011 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARSE-205 | ENST00000540563 | 1990 nt | TSL 2 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VRK2-207 | ENST00000440705 | 1676 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NME6-213 | ENST00000451657 | 871 nt | TSL 2 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HES2-205 | ENST00000487437 | 968 nt | TSL 3 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DIMT1-202 | ENST00000506390 | 1208 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RRAS2-203 | ENST00000526063 | 970 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RRAS2-208 | ENST00000532814 | 982 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01956-201 | ENST00000557729 | 695 nt | TSL 5 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEBPA-201 | ENST00000498907 | 2631 nt | APPRIS P1 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ME3-202 | ENST00000393324 | 2240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM161A-202 | ENST00000450333 | 1930 nt | TSL 2 BASIC | 19.12 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OBSL1-214 | ENST00000603926 | 5520 nt | TSL 5 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | JADE2-204 | ENST00000402835 | 2797 nt | TSL 5 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATF5-202 | ENST00000595125 | 1637 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HRK-201 | ENST00000257572 | 5789 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PABPC4-204 | ENST00000372862 | 2470 nt | TSL 5 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TUBGCP3-204 | ENST00000464139 | 2461 nt | TSL 1 (best) BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDRG2-242 | ENST00000555158 | 2216 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NOXO1-203 | ENST00000397280 | 1147 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01637-201 | ENST00000444039 | 684 nt | TSL 2 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097658.1-201 | ENST00000475555 | 843 nt | BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYL5-206 | ENST00000506838 | 2956 nt | TSL 2 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CTBP1-AS2-203 | ENST00000507044 | 739 nt | TSL 3 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138028.5-201 | ENST00000566114 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BRWD1-AS2-201 | ENST00000603064 | 1028 nt | BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005224.2-201 | ENST00000571192 | 1885 nt | TSL 2 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AVPR2-202 | ENST00000358927 | 1763 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 19.11 | ■□□□□ 0.65 | | |