Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA4Q13772 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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