Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC1Q13547 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC1Q13547 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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