Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TROQ12816 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TROQ12816 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TROQ12816 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TROQ12816 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TROQ12816 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TROQ12816 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TROQ12816 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TROQ12816 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TROQ12816 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TROQ12816 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TROQ12816 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TROQ12816 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TROQ12816 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TROQ12816 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TROQ12816 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TROQ12816 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
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