Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF5Q12774 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF5Q12774 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF5Q12774 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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